Los 319 kilómetros de especial por los alrededores de Copiapó, en pleno desierto de Atacama, no arrojó tantos cambios como podría preverse visa la naturaaleza del terreno, debido a que las temperaturas no eran tan elevadas como en otras ocsiones y el terreno, por tanto, estaba más firme, sobre todo en las partes de dunas.
La joranda comenzó con un largo enlace en el que los participantes atravesaaron el paso de San Francisco para acceder de nuevo a Chile. Una vez en terriotorio chileno dio comienzo la especial en la que Roma salió desde el principio con la clara intención de restarle tiempo a su compañero Novitskyi.
Salto al podio
El piloto de Folgueroles mantuvo un alto ritmo durante toda la crono y, a pesar de pinchar un neumático justo al final de la especial, pudo imponerse por más de cuatro minutos a Gordon y De Villiers –segundo y tercero en la etapa, respectivamente–. El de Mini, también se vio beneficiado por algunos errores de conducción del americano y de Peterhansel –se quedó un poco enganchado en la arena y tuvo que utilizar las planchas–, no obstante, el galo sigue firme enla primera posición de la general y administra sus más de 50 minutos de ventaja. En esta etapa finalizó en cuarta posición, cediendo seis minutos respecto a Roma. Pero lo más importante fueron los más de 15 minutosde ventaja que sacó a Leonid Novitskyi y que le sirven para arrebatarle la tercera plaza de la general, aunque por un estrecho margen de tres minutos que deberá defender en los 500 kilómetros de especiales que aún quedan por delante.
Xavi Foj no tuivo un buen día y cedió 40 minutos con Nicolás Gibon, por lo que ahora sólo le separan 23 minutos del pilot francés del equipo oficial de Toyota
En la categoría camiones, la carrera se ha convertido en un duelo entre Kamaz, recordando a los años de dominio arrasador de la firma rusa, en que copaban todas las victorias parciales y lo primeros puestos de la general. en esta edición las victorias de etapa están muy disputadas y han conseguido gaanr los Iveco, Tatra y Man, pero en la general, Andrey Karginov, tercero en la general, consiguió una segunda victoria en este Dakar 2013, la cuarta de su carrera, pero con una ventaja de tan solo 2’36 sobre su compatriota y gran rival, Ayrat Mardeev, con quien disputa el segundo puesto de la clasificación general. por su parte, Mardeev, tan regular como siempre, logra sacar 13» a Gerard de Rooy, autor de un inicio de especial extraordinario, aunque rápidamente quedó a la zaga debido a un pinchazo. No hay cambios en la general: Nikolaev corona la clasificación con un margen de 31’20 frente a Mardeev y de 50’26 frente a Karginov.
La etapa número 13, penúltima de esta edición discurre entre las localidades chilenas de Copiapó y La Serena on una especial de 441 kilómetros en los que todavía quedará algo de dunas, pero que básicamente serán largos tramos de pistas, donde el mayor peligro pueden ser las abundantes piedras que alberga el recorrido.
Clasificación de la 12ª etapa
| Pos. | Dorsal | Piloto/Copiloto | Vehículo | Tiempo |
| 1 | 305 | Roma (ESP)/Périn (FRA) | Mini | 03:36:34 |
| 2 | 315 | Gordon (USA)/Walch (USA) | Hummer | a 00:04:18 |
| 3 | 301 | De Villiers (ZAF)/Von Zitzewitz (DEU) | Toyota | a 00:04:25 |
| 4 | 302 | Peterhansel (FRA)/Cottret (FRA) | Mini | a 00:06:03 |
| 5 | 313 | Terranova (ARG)/Fiuza (PRT) | BMW | a 00:06:26 |
| 6 | 306 | Álvarez (ARG)/Graue (ARG) | Toyota | a 00:09:25 |
| 7 | 308 | Sousa (PRT)/Ramalho (PRT) | Great Wall | a 00:09:58 |
| 8 | 316 | Chabot (FRA)/Pillot (FRA) | SMG | a 00:10:18 |
| 9 | 307 | Novitskiy (RUS)/Zhiltsov (RUS) | Mini | a 00:15:10 |
| 10 | 322 | Zhou (CHN)/Maimon (FRA) | Great Wall | a 00:22:48 |
Clasificación general después de la 12ª etapa
| Pos. | Dorsal | Piloto/copiloto | Vehículo | Tiempo |
| 1 | 302 | Peterhansel (FRA)/Cottret (FRA) | Mini | 32:50:02 |
| 2 | 301 | De Villiers (ZAF)/Von Zitzewitz (DEU) | Toyota | a 00:50:21 |
| 3 | 305 | Roma (ESP)/Périn (FRA) | Mini | a 01:31:06 |
| 4 | 307 | Novitskiy (RUS)/Zhiltsov (RUS) | Mini | a 01:34:47 |
| 5 | 313 | Terranova (ARG)/Fiuza (PRT) | BMW | a 02:01:50 |
| 6 | 308 | Sousa (PRT)/Ramalho (PRT) | Great Wall | a 02:39:46 |
| 7 | 316 | Chabot (FRA)/Pillot (FRA) | SMG | a 03:03:11 |
| 8 | 309 | CHICHERIT (FRA)/Garcin (FRA) | SMG | a 03:42:51 |
| 9 | 328 | Thomasse (FRA)/Larroque (FRA) | Buggy MD Rallye | a 04:14:26 |
| 10 | 337 | Olholm (AUS)/Aston (GBR) | Toyota | a 04:29:11 |
